Der Hauptgrund für eine Tomaten Unverträglichkeit lässt sich auf den indirekten Effekt des Histaminspiegels zurückführen. Beim Verzehr von Tomaten wird das bereits im Körper eingelagerten Histamin wieder freigesetzt.
Dies sollte besonders bei Allergiekern bekannt sein. In Kombination mit anderen histaminhaltigen Lebensmitteln, kann es zu einem allergischen Schock kommen. Aus diesem Grund werden Tomaten auch als Histaminliberatoren bezeichnet.